Il laboratorio chimico è dotato di strumentazione in grado di effettuare prove chimiche dalle più semplici alla più complesse. Il personale è altamente specializzato e vanta un'esperienza decennale nel controllo analitico degli alimenti. Il laboratorio presenta una sezione dedicata al mondo del latte e dei suoi derivati.

Le prove analitiche che vengono condotte vanno dalla composizione centesinale delle materie prime, dei semilavorati, dei prodotti finiti, all'etichettatura nutrizionale, alle prove analitiche sull'acqua potabile, sulle acque reflue e di processo ad analisi più complesse quali ricerca di additivi, tossine, allergeni, diossine, metalli pesanti, multiresiduale.